يعتمد المعهد على احدث المناهج الدراسية المعتمدة في الجامعات العالمية الرصينة و يسعى دائما” على تطويرها . وتجدر الأشارة هنا الى أن كافة المناهج الدراسية تدرس باللغة الأنكليزية وهي أيضا لغة الرسائل و الأطاريح العلمية .
1- فرع التطبيقات الطبية و البايولوجية
عدد البرامج الدراسية في الفرع اثنان وهما :
برنامج الماجستير
(طب اسنان , علوم حياة)
أن هدف هذا البرنامج هو رفد الجامعات العراقية والمجتمع بكوادر تدريسية مؤهلة في علوم الليزر وتطبيقاته المختلفة في طب الاسنان و العلوم الصرفة
يقبل في هذا البرنامج حملة شهادة البكالوريوس في تخصصات علوم الحياة وطب الاسنان , بدأ القبول على هذا البرنامج في العام الدراسي ١٩٩٧-١٩٩٨ .
برنامج الدبلوم العالي الليزر في الطب
(جراحة جلدية, جراحة عامة, نسائية وتوليد , طب العيون, مجاري بولية, انف واذن وحنجرة)
يهدف هذا البرنامج الى تأهيل الكوادر الطبية المتخصصة القادرة على استخدام الليزر بشكل علمي مبني على أسس أكاديمية مدروسة متوخين الدقة في أستخدامه حفاظاً على الطبيب و المريض على حد سواء .
يقبل على هذا البرنامج الأطباء الأختصاص حصراً , بدأ القبول على هذا البرنامج في العام الدراسي ٢٠٠٢-٢٠٠٣ .
عدد التدريسيين في الفرع
اثناعشر تدريسي
اربعة دكتوراه وثمانية ماجستير
عدد طلاب الفرع الكورسات ومرحلة البحث
ستة واربعون طالبا
2- فرع التطبيقات الهندسية والصناعية
عدد البرامج الدراسية في الفرع اثنان وهما:
برنامج الماجستير
(هندسة الكترونيك واتصالات, هندسة ميكانيك,علوم فيزياء, علوم كيمياء)
أن هدف هذا البرنامج هو رفد الجامعات العراقية والمجتمع بكوادر تدريسية مؤهلة في علوم الليزر وتطبيقاته المختلفة في العلوم الصرفة والهندسية والطبية .
يقبل على هذا البرنامج حملة شهادة البكالوريوس في تخصصات علوم الكيمياء والفيزياء والهندسة الألكترونية والأتصالات والهندسة الميكانيكية وهندسة الأنتاج والمعادن , بدأ القبول على هذا البرنامج في العام الدراسي ١٩٩٧-١٩٩٨ .
برنامج الدكتوراه
(هندسة الكترونيك وإتصالات,هندسة ميكانيك, علوم فيزياء)
لتغطية النقص الكبير في الملاكات التدريسية العليا في مجال الليزر فقد تم أستحداث برنامج للدكتوراه أعتبارا من العام الدراسي ٢٠٠٣-٢٠٠٤ و يقبل على هذا البرنامج  حملة الماجستير في الهندسة الألكترونية والأتصالات والهندسة الميكانيكية والفيزياء  .
عدد التدريسيين في الفرع
ثمانية عشر تدريسي
عشرة دكتوراه وثمانية ماجستير
عدد طلاب الفرع الكورسات ومرحلة البحث
ثلاثة وستون طالبا