يعتمد المعهد على احدث المناهج الدراسية المعتمدة في الجامعات العالمية الرصينة و يسعى دائما” على تطويرها . وتجدر الأشارة هنا الى أن كافة المناهج الدراسية تدرس باللغة الأنكليزية وهي أيضا لغة الرسائل و الأطاريح العلمية .
1– الدبلوم العالي لليزر في الطب
 
يهدف هذا البرنامج الى تأهيل الكوادر الطبية المتخصصة القادرة على استخدام الليزر بشكل علمي مبني على أسس أكاديمة مدروسة متوخين الدقة في أستخدامه حفاظاً على الطبيب و المريض على حد سواء .
يقبل على هذا البرنامج الأطباء الأختصاصين حصراً في تخصصات العيون والجلدية والجراحة العامة والجراحة التقويمية والأنف و الأذن والحنجرة والنسائية وجراحة الوجه والفكين . بدأ القبول على هذا البرنامج في العام الدراسي 2002/2003 .
 
2- الماجستير
 
أن هدف هذا البرنامج هو رفد الجامعات العراقية والمجتمع بكوادر تدريسية مؤهلة في علوم الليزر وتطبيقاته المختلفة في العلوم الصرفة والهندسية والطبية .
يقبل على هذا البرنامج حملة شهادة البكالوريوس في تخصصات علوم الحياة والفيزياء والهندسة الألكترونية والأتصالات والهندسة الميكانيكية وهندسة الأنتاج والمعادن  وطب الأسنان والطب البيطري . بدأ القبول على هذا البرنامج في العام الدراسي 1997-1998 .
 
 
3- الدكتوراه
 
لتغطية للنقص الكبير في الملاكات التدريسية العليا في مجال الليزر فقد تم أستحداث برنامج للدكتوراه أعتبارا من العام الدراسي 2003-2004 و يقبل على هذا البرنامج  حملة الماجستير في الهندسة الألكترونية والأتصالات والهندسة الميكانيكية والفيزياء وطب الأسنان وعلوم الحياة .
 
 اما المناهج الدراسية لمعهد االليزر فهي:
المناهج الدراسية – معهد الليزر – معهد الليزر للدراسات العليا (uobaghdad.edu.iq)